Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVBPQ8N300 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVBPQ8N300 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms