Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC83Q8IWF9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC83Q8IWF9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms