Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVG5

SAMD9L, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9LQ8IVG5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SAMD9LQ8IVG5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAMD9LQ8IVG5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms