Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC73Q6ZRK6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC73Q6ZRK6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms