Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFXL1Q6ZNB6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NFXL1Q6ZNB6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms