Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC171Q6TFL3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms