Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED8Q6PL24 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED8Q6PL24 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms