Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC144NLQ6NUI1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms