Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms