Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCN1P1Q5VSP4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms