Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf47Q569G3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms