Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms