Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms