Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HFEQ30201 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HFEQ30201 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HFEQ30201 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HFEQ30201 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HFEQ30201 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HFEQ30201 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HFEQ30201 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HFEQ30201 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HFEQ30201 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms