Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf58Q2M2W7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms