Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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