Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPROQ16827 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPROQ16827 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms