Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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