Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN1Q16799 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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