Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYPL1Q16563 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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