Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms