Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR6A1Q15406 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms