Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3CQ15386 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms