Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3HDM1Q15032 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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