Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC10A1Q14973 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms