Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 AC073365.1-202ENST00000642133 2253 nt7.29□□□□□ -1.247e-7■□□□□ 9.3
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PUM1Q14671 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.337e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 AC073365.1-205ENST00000438488 494 ntTSL 56.39□□□□□ -1.397e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.18□□□□□ -1.427e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 AC073365.1-201ENST00000641158 1695 nt5.94□□□□□ -1.467e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 AC073365.1-204ENST00000439804 901 ntTSL 25.27□□□□□ -1.577e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PAIP1-210ENST00000515338 726 ntTSL 54.93□□□□□ -1.627e-7■□□□□ 9.3
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PUM1Q14671 YARS-206ENST00000478828 1044 ntTSL 212.58□□□□□ -0.45e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 YARS-203ENST00000469100 2247 ntTSL 211.07□□□□□ -0.645e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 YARS-208ENST00000487404 2197 ntTSL 210.31□□□□□ -0.765e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HMG20B-205ENST00000435022 616 ntTSL 523.91■■□□□ 1.427e-8■□□□□ 9.3
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PUM1Q14671 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-8■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-8■□□□□ 9.3
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PUM1Q14671 RPS16-205ENST00000599705 407 ntTSL 38.81□□□□□ -12e-8■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.071e-8■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-6■□□□□ 9.3
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PUM1Q14671 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.61■■■□□ 2.331e-7■□□□□ 9.3
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PUM1Q14671 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.253e-7■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 03e-7■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCDC136-214ENST00000494552 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.39□□□□□ -0.913e-7■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCDC136-201ENST00000297788 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.963e-7■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCDC136-209ENST00000480137 3732 ntTSL 28.34□□□□□ -1.073e-7■□□□□ 9.2
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PUM1Q14671 APLP2-220ENST00000533618 574 ntTSL 422.39■■□□□ 1.172e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 APLP2-221ENST00000533713 560 ntTSL 422.39■■□□□ 1.172e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 APLP2-223ENST00000534001 585 ntTSL 422.39■■□□□ 1.172e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 522.39■■□□□ 1.172e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 517.75■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 APLP2-211ENST00000529235 537 ntTSL 416■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.149e-8■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.359e-8■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.369e-8■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.489e-8■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ACIN1-206ENST00000473758 3540 ntTSL 1 (best)10.65□□□□□ -0.79e-8■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCNL2-216ENST00000488340 1598 ntTSL 220.57■□□□□ 0.882e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCNL2-213ENST00000481223 2815 ntTSL 217.51■□□□□ 0.392e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCNL2-215ENST00000482621 2059 ntTSL 214.43□□□□□ -0.12e-10■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 CCNL2-218ENST00000496007 4452 ntTSL 212.82□□□□□ -0.362e-10■□□□□ 9.2
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PUM1Q14671 ZNF146-204ENST00000587285 571 ntTSL 1 (best)9.05□□□□□ -0.962e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.982e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ZNF146-203ENST00000586094 565 ntTSL 27.92□□□□□ -1.142e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.512e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ZNF146-205ENST00000591063 533 ntTSL 24.19□□□□□ -1.742e-13■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.154e-6■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 SRSF11-213ENST00000481648 389 ntTSL 310.31□□□□□ -0.764e-6■□□□□ 9.2
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