Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms