Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPM6BQ13491 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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