Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms