Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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SKP2Q13309 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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SKP2Q13309 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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