Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SCGB2A2Q13296 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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