Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDRQ13258 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDRQ13258 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDRQ13258 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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