Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms