Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EGR4Q05215 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms