Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms