Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms