Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF8Q02556 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms