Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms