Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms