Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDC42EP1Q00587 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP1Q00587 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms