Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNB1P98172 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms