Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP2P81877 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP2P81877 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms