Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS28P62857 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS28P62857 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS28P62857 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS28P62857 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS28P62857 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS28P62857 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS28P62857 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms