Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS3AP61247 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS3AP61247 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms