Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms