Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP25P60880 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms