Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN8P56748 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms