Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NME5P56597 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME5P56597 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME5P56597 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME5P56597 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms