Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FNTAP49354 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FNTAP49354 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTAP49354 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTAP49354 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTAP49354 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTAP49354 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTAP49354 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FNTAP49354 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FNTAP49354 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms