Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPR4P46093 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPR4P46093 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPR4P46093 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPR4P46093 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPR4P46093 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPR4P46093 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPR4P46093 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPR4P46093 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR4P46093 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR4P46093 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPR4P46093 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR4P46093 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms